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“100家實(shí)驗(yàn)室”專(zhuān)題:訪農(nóng)科院農(nóng)作物基因資源與基因改良國(guó)家重大科學(xué)工程實(shí)驗(yàn)室
農(nóng)作物基因資源與基因改良國(guó)家重大科學(xué)工程,是由原國(guó)家發(fā)展計(jì)劃委員會(huì)投資約1.4億元,以中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院為依托單位建立的我國(guó)農(nóng)業(yè)及生物領(lǐng)域目前唯一的一個(gè)國(guó)家重大科學(xué)工程,該工程下轄開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室(以下簡(jiǎn)稱(chēng)“實(shí)驗(yàn)室”)于2003年11月竣工并投入使用。它是我國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)基礎(chǔ)研究與應(yīng)用基礎(chǔ)研究領(lǐng)域能力建設(shè)的重大進(jìn)步和標(biāo)志性工程。實(shí)驗(yàn)室作為國(guó)家級(jí)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室,曾經(jīng)接待過(guò)多位國(guó)家領(lǐng)導(dǎo)人的參觀及48個(gè)國(guó)家的農(nóng)科院院長(zhǎng)的訪問(wèn)。
實(shí)驗(yàn)室外景
實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn)員趙新先生熱情接待了儀器信息網(wǎng)到訪人員,并詳細(xì)介紹了實(shí)驗(yàn)室情況!敖⒅,國(guó)家重大科學(xué)工程儀器設(shè)備共69類(lèi)468臺(tái)(套),購(gòu)置費(fèi)8053.38萬(wàn)元,具有多功能、高通量、高效率、自動(dòng)化、網(wǎng)絡(luò)化和簡(jiǎn)單化等特點(diǎn)。各類(lèi)儀器先進(jìn)性與實(shí)用性相結(jié)合,大、中、小型儀器設(shè)備相配套。日前我們又購(gòu)置了一些新儀器!
“實(shí)驗(yàn)室的儀器大致可歸到以下四類(lèi):基因組學(xué)技術(shù)平臺(tái)、蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)平臺(tái)、分析檢測(cè)技術(shù)平臺(tái)以及實(shí)驗(yàn)室常用設(shè)備!
“基因組學(xué)技術(shù)平臺(tái)是實(shí)驗(yàn)室中儀器設(shè)備最為完善的平臺(tái),擁有多臺(tái)先進(jìn)儀器,還能提供EST文庫(kù)構(gòu)建測(cè)序服務(wù)、Shotgun文庫(kù)構(gòu)建服務(wù)、DNA片段分析技術(shù)服務(wù)以及ROCHE公司超高通量基因組測(cè)序系統(tǒng)!
Applied Boisystrns公司全自動(dòng)3730XL DNA測(cè)序儀
(圖注:實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)有3臺(tái)該儀器。)
Roche公司454高通量基因測(cè)序儀
(圖注:該儀器為實(shí)驗(yàn)室最近購(gòu)置,是最新的基因組測(cè)序儀,尤其適合檢測(cè)植物基因組,還可檢測(cè)小RNA。儀器使用非常簡(jiǎn)便,只需要一步簡(jiǎn)單的全基因組樣品制備過(guò)程,就可以在短時(shí)間內(nèi)快速獲得大量的堿基信息,且準(zhǔn)確率達(dá)到99%以上。)
Applied Boisystrns公司7900高通量實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀
(圖注:該儀器在此類(lèi)儀器中是最為先進(jìn)的,具有超高的檢測(cè)靈敏度及最低的試劑用量需求,全自動(dòng)化操作,可實(shí)現(xiàn)多次收集信號(hào)。這款儀器在定機(jī)之初就必須選擇應(yīng)用板孔,該實(shí)驗(yàn)室的是適用于384孔板樣品的。目前全北京就只有兩臺(tái)該儀器,除了這一臺(tái)外,另一臺(tái)在ABI公司當(dāng)展品。此外,實(shí)驗(yàn)室還擁有ABI公司的7000型以及7300型實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀各一臺(tái)。7000實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀是型號(hào)較老的儀器,儀器的程序設(shè)置不太人性化,靈活性也不夠高,只能在整個(gè)升溫程序的最后一步收集信號(hào),但該儀器的預(yù)定情況較好,經(jīng)常連續(xù)工作,幾乎不關(guān)機(jī)。)
BIO-RAD公司iCycler熒光定量PCR儀
(圖注:該儀器擁有優(yōu)秀的控制與分析軟件,具有操作、分析及維護(hù)簡(jiǎn)便易行的特點(diǎn)。相關(guān)附件為定量PCR試劑盒以及光學(xué)級(jí)PCR管。這款熒光定量PCR的程序設(shè)計(jì)比較靈活,收集數(shù)據(jù)也可分步設(shè)置,使用者都說(shuō)好用。)
GENETIX公司Qpix2機(jī)器人挑取克隆系統(tǒng)
(圖注:該儀器是挑取克隆菌落的高效自動(dòng)化設(shè)備,它可在短時(shí)間內(nèi)完成挑取克隆、復(fù)制、點(diǎn)膜等工作,適用于cDNA文庫(kù)構(gòu)建,它的活動(dòng)機(jī)械臂上配有高像素?cái)z像頭,可以用圖像定位自動(dòng)搜尋符合要求的菌落并將其從大盤(pán)培養(yǎng)基上挑取到96孔或384孔板上。)
“基因組學(xué)技術(shù)平臺(tái)還有三臺(tái)大型的機(jī)器人系統(tǒng),分別是:Beckman公司Multimek384自動(dòng)化工作站和FX自動(dòng)化工作站以及Roche公司的MagNA Pure LC自動(dòng)DNA提取儀!
Beckman公司Multimek 384自動(dòng)化工作站
(圖注:該儀器是連續(xù)自動(dòng)加樣系統(tǒng),是個(gè)單臂的機(jī)器人,配有一個(gè)384頭的移液器,用于液體加樣的操作,可以精確地移取、混合液體樣品。)
Roche公司的MagNA Pure LC自動(dòng)DNA提取儀
(圖注:該儀器可以快速的提取細(xì)胞、組織中的DNA或RNA,在提取的過(guò)程中可以有效的防止交叉污染。)
Beckman公司FX自動(dòng)化工作站
(圖注:該儀器是加樣機(jī)器人,用于液體樣品的加樣及混合。FX為雙臂機(jī)器人,同時(shí)裝有8個(gè)單頭和1個(gè)96頭移液器,適用于各類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)或非標(biāo)容器。)
“蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)平臺(tái)也是裝備比較齊全的技術(shù)平臺(tái),可提供從樣本制備、樣品標(biāo)記、雙向電泳分離、圖像獲取、圖像分析到自動(dòng)挖膠、酶切和點(diǎn)質(zhì)譜靶等一整套技術(shù)的平臺(tái)。整個(gè)過(guò)程從圖像分析開(kāi)始全部實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化,足以滿(mǎn)足蛋白質(zhì)組學(xué)大量研究工作的需求。其中,雙向電泳技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究領(lǐng)域中重要的樣品分析手段!
GE公司AKTA purifier蛋白質(zhì)純化層析系統(tǒng)
(圖注:該儀器適用于各種層析技術(shù),專(zhuān)門(mén)分離和純化各類(lèi)生物分子。據(jù)悉,該實(shí)驗(yàn)室擁有4臺(tái)AKTA purifier系列儀器,型號(hào)分別為purifier100、purifier 10+、basic 10。)
GE公司雙向電泳系統(tǒng)
(圖注:左側(cè)是專(zhuān)門(mén)用來(lái)跑第一項(xiàng)的(IEF),可設(shè)定多個(gè)程序,一般水化膠條和等電點(diǎn)聚焦可以一起做,能保證恒溫20℃,總時(shí)長(zhǎng)需要30小時(shí)以上;它的相關(guān)配件是水化盤(pán),平衡盤(pán),帶電極的陶瓷條,每件東西都是價(jià)值不菲。右側(cè)呈現(xiàn)的是雙向電泳的電泳槽+電源+循環(huán)冷水浴,其中電泳槽+電源是GE品牌的,電泳槽可是跑24㎝膠條的,里面是鉑金電極絲;電源可預(yù)先設(shè)定程序,實(shí)現(xiàn)倒計(jì)時(shí)或正計(jì)時(shí),并且可以同時(shí)提供兩臺(tái)電泳槽的用電;和它們相配套的是注膠模具、上下玻璃板、上槽和膠架,其中玻璃板是經(jīng)過(guò)特殊加工的,每塊板價(jià)值上千元。整套雙向電泳的使用成本較高。)
GE公司UMAX PowerLook 1120 白光掃描儀
(圖注:該儀器成像效果很好,可掃描真彩和灰度兩種膠圖,儲(chǔ)存格式為tif,操作便捷,帶有分析軟件,可根據(jù)同一樣品的重復(fù)試驗(yàn)?zāi)z所掃描的灰度膠圖的不同判斷出蛋白含量的變化,根據(jù)蛋白的變化就可以進(jìn)一步判斷植物生長(zhǎng)過(guò)程中的各種性狀變化所引起的植物內(nèi)在變化;它的配套設(shè)施比較簡(jiǎn)單,就是進(jìn)口無(wú)塵紙,這種紙擦拭掃描儀玻璃表面時(shí)幾乎不留下紙屑和雜物。)
Typhooe熒光成像系統(tǒng)
(圖注:這一臺(tái)儀器是用來(lái)掃描熒光的,可以是經(jīng)過(guò)熒光標(biāo)記的普通植物組織,也可以是電泳膠;價(jià)格高于30萬(wàn)美元;該儀器日常保養(yǎng)和維護(hù)比較簡(jiǎn)單。)
GE公司Ettan Spot Picker全自動(dòng)斑點(diǎn)切割系統(tǒng)
(圖注:該儀器也叫做“挖膠儀”,跑完電泳做完對(duì)比分析之后用來(lái)挖膠點(diǎn)。可移動(dòng)機(jī)械臂上帶有攝像頭,系統(tǒng)可根據(jù)圖像資料尋找需要挖的膠點(diǎn)并把挖到的膠點(diǎn)放進(jìn)96孔板或者其他型號(hào)的板子里,以供后面質(zhì)譜分析使用。)
DeCyder專(zhuān)業(yè)蛋白凝膠圖像分析軟件
(圖注:該軟件能快速處理大量2-D蛋白電泳凝膠圖像。據(jù)了解,該軟件價(jià)格不菲。)
Bruker公司Autoflex基質(zhì)輔助激光解析飛行時(shí)間質(zhì)譜儀(MALDI-TOF)
“分析檢測(cè)技術(shù)平臺(tái)包含各類(lèi)分析儀器,例如液質(zhì)聯(lián)用儀、氣質(zhì)聯(lián)用儀、毛細(xì)管電泳儀、超高效液相色譜儀、激光共聚焦顯微鏡、近紅外品質(zhì)分析儀、核磁共振油份分析儀等儀器,可提供常規(guī)的分析測(cè)試服務(wù)!
分析檢測(cè)技術(shù)平臺(tái)的部分儀器
“實(shí)驗(yàn)室常用設(shè)備很多,包括電穿孔系統(tǒng)、脈沖場(chǎng)電泳儀、超速離心機(jī)、冷凍干燥機(jī)、電洗脫儀、半干轉(zhuǎn)印儀、超聲波細(xì)胞破碎儀、真空濃縮儀、自動(dòng)分液系統(tǒng)、氮吹儀、全自動(dòng)流動(dòng)微波多肽合成系統(tǒng)、超濾系統(tǒng)等儀器。”
部分實(shí)驗(yàn)室常用設(shè)備
“整個(gè)重大科學(xué)工程實(shí)驗(yàn)室的儀器設(shè)備面向全國(guó)開(kāi)放,提供DNA測(cè)序、蛋白質(zhì)測(cè)序、文庫(kù)構(gòu)建、同位素實(shí)驗(yàn)室工作、蛋白質(zhì)組平臺(tái)科研合作等服務(wù)。實(shí)驗(yàn)室建有網(wǎng)上預(yù)約系統(tǒng),該預(yù)約系統(tǒng)幾經(jīng)改版,已比較人性化,用戶(hù)在網(wǎng)上就可預(yù)約儀器設(shè)備,非常方便。目前,儀器的預(yù)約情況良好!
趙新實(shí)驗(yàn)員為儀器信息網(wǎng)工作人員介紹儀器
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