《自然-方法學(xué)》：可視蛋白質(zhì)組學(xué)

瑞士聯(lián)邦技術(shù)學(xué)院的研究人員開發(fā)出一種在問號鉤端螺旋體(Leptospira interrogans)這種病原體中定位蛋白復(fù)合物的新方法，稱為“可視蛋白質(zhì)組學(xué)”。文章發(fā)表在本期的《自然-方法學(xué)》上。

　　活細(xì)胞中的生化進程分為多個功能單元，它們在細(xì)胞內(nèi)有著特定的時間和空間分布。一般來說，這些單元是相互作用蛋白形成的復(fù)合物。定量質(zhì)譜常常用于確定蛋白復(fù)合物的組成，但這種方法需要多個細(xì)胞的裂解液，但這樣一來，空間信息就損失了，特定細(xì)胞的特有性質(zhì)也就看不見了。

　　低溫電子斷層掃描術(shù)(cryoET)是一種三維觀察細(xì)胞的成像技術(shù)。在目前可實現(xiàn)的分辨率下，它能鑒定并定位冰凍含水標(biāo)本中的大蛋白復(fù)合物。這是通過模板匹配來實現(xiàn)的，將代表特定蛋白復(fù)合物的信號與cryoET收集的信號聯(lián)系起來。多個蛋白復(fù)合物的結(jié)構(gòu)特點組合，就有可能描述出特定細(xì)胞的立體蛋白質(zhì)組結(jié)構(gòu)，這個過程就稱為“可視蛋白質(zhì)組學(xué)”。這種方法已經(jīng)應(yīng)用到無細(xì)胞系統(tǒng)中，它在完整細(xì)胞中的應(yīng)用還只限于核糖體。主要局限在于難以將真正的模板匹配和假陽性區(qū)分開來，因為低溫電子斷層照片的信噪比相當(dāng)?shù)汀?/FONT>